去年的一项最新发明，表观遗传学测试EPICUP®，让医生有能力区分已经发生转移的未知性癌症（Cancer of Unknown Primary，CUP）患者属于哪种原发肿瘤类型。7月6日《Nature Reviews Clinical Oncology》（《自然评论：临床肿瘤学》，影响因子20.69）发表了这项发明的相关优势和转移到临床实践的最新进展。                  

未知性癌症（CUP）在转移性肿瘤患者中占比10%，然而这些癌症的原发肿瘤位置通常无法确定。由于无法分辨究竟是哪种肿瘤类型，这些患者的生存率很低。

“传统方法只能鉴定30%不明病灶的转移性肿瘤的原发肿瘤位置，一些分子生物学方法可以提高这一比例，但往往造价昂贵，并且，所使用的RNA样本比较脆弱容易在医院进行解剖操作时被损坏，”文章作者、Bellvitge生物医学研究所（IDIBELL）表观遗传学与肿瘤生物学项目协调人Manel Esteller博士解释道。

“EPICUP®检测则是基于更稳定的DNA分子，允许医务人员以更简单的方式进行采集、保存和运输。一周之内即可出具检测报告。”

革命性的EPICUP®检测将使CUP的检测和治疗更加有效。正如文中总结：“正确的、更特异性的、低侵袭性诊断试验可使CUP患者从中受益。”

表观遗传学机制通常被理解为“在不改变DNA序列的条件下的基因表达水平调控机制”。尽管染色质重塑、非编码RNAs、DNA-蛋白质相互作用、转座因子流动性抑制、细胞分化、X染色体失活和基因印记等因素也能调控基因表达，但是哺乳动物细胞中的胞嘧啶碳五的甲基化共价修饰仍起主导表观遗传学作用。

可遗传的、在发育过程中具有持续表现力的表观遗传标签变化已被证明是同一基因型下生成多种表型的重要原因。在不恰当的时间地点添加错误类型的表观遗传学标记与许多疾病（包括癌症）的发生息息相关。更重要的是，DNA甲基化抑制许多抑癌基因表达，如CDKN2A，CDKN2B，MLH1，MGMT和CDH1等，从而影响癌症进程。

具有相同组织病理学和遗传特征的肿瘤可能表现出完全不同的表型。举一个明显的例子，同样是BRAFV600E 突变型黑色素瘤，虽然低甲基化赋予了机体对BRAF和MEK抑制剂的更大敏感性，但是TBC1D16-47KD转录本的表观遗传学再活化将导致更差（高出4倍风险）预后。

因此，揭示肿瘤特异性指纹甲基化CpG岛的DNA甲基化谱不仅能识别肿瘤类型，还可预测患者预后和抗肿瘤治疗反应。

科学家们使用高通量方法，首次探访了超过1000名患者组织样品的1505个CpG位点，绘制了DNA甲基化图谱，鉴定出24种不同肿瘤类型的特定指纹。在此之前的大多数DNA甲基化模式研究仅局限于少数患者的、屈指可数的特定基因组位点。

根据文中展望，DNA甲基化分子检测平台将成为癌症临床诊断的必要趋势。

（本文转载生物通）