1.shRNA序列设计与合成
(1)客户提供干扰序列;
(2)针对目的基因中洪代为设计并合成三对特异性的siRNA序列,根据siRNA序列设计对应茎环结构的shRNA序列,然后合成三对shRNA序列(结果中保证其中一条干扰效率不低于70%)。
2.shRNA慢病毒载体构建
将三个shRNA分别克隆入慢病毒载体,构建shRNA干扰慢病毒载体,并进行测序鉴定构建成功。
二、目的基因干扰慢病毒载体的包装和浓缩
1.慢病毒载体的大量包装
大量扩增效率三组shRNA慢病毒载体和慢病毒的辅助质粒,将三个质粒按一定比例大量转染293T细胞,进行慢病毒颗粒的大量包装。
2. 慢病毒的浓缩
包装48小时后收集病毒,并对病毒进行体外大比例浓缩,得到有效滴度为10^8PFU/ml的慢病毒颗粒