小泛素相关修饰(SUMO)是生物内极为重要的一种蛋白翻译后修饰方式,是一类广泛存在于真核生物中且高度保守的蛋白质家族,它在调节蛋白质间相互作用、定位、转运、转录、细胞周期以及拮抗泛素化等方面均发挥着重要的作用。
SUMO修饰是指SUMO共价结合于靶蛋白的赖氨酸残基上,类似于泛素化但又不同于泛素化。SUMO通常是非活性的前体形式存在,在酶作用下水解几个氨基酸暴露出C端双甘氨酸残基,成为具有活性的SUMO分子。当ATP存在时,经SUMO活化酶E1、SUMO结合酶E2、SUMO连接酶E3的连续作用,最终与靶蛋白底物耦联形成异肽键,完成底物的SUMO修饰。
SUMO背景介绍:
SUMO化修饰与一些重要疾病相关联。SUMO 化能影响淀粉样前体蛋白产生淀粉样β肽(A β),其机制尚不清楚。过表达SUMO23,诱导SUMO化 蛋白增加可抑制ʌβ的产生,过表达SUMO232K11R (其参与形成多SUMO链的赖氨酸残基敲除)则可 产生相反的效应,说明单SUMO化可增强ʌβ的形成,而多SUMO化则抑制ʌβ的形成。多聚谷氨酸(polyQ)重复扩增可引起何杰金氏病(HD)、脊髓小脑共济失调、Machado2Joseph病和 延髓脊髓性肌萎缩等神经退行性疾病。研究显示,患这些疾病的患者受损脑区神经元SUMO21染色增强,说明SUMO化修饰也参与调节polyQ的重复扩增。应用HD果蝇模型证明Huntingtin(Htt)的polyQ区的一个片段,既可被SUMO化,又可被泛素化。泛素化可消除神经退行性变,然而SUMO化则可加剧神经退行性变。SUMO化的Htt稳定,不易聚集,具有较强的抑制转录能力。SUMO化促进可溶性毒性Htt寡聚体的聚集,通过抑制转录而 介导神经退行性变。
1、感受态细胞的制备
(1)准备LB培养基:0.5%酵母浸提物、1%胰蛋白胨、1%NaCl(PH 7.0),高压灭菌,4℃保存备用。
(2)准备LB琼脂平板:取新鲜配置的100-200ml的LB培养基,加入1.5g琼脂糖,高压灭菌,冷却至60℃,液体倒入已消毒的平皿中,凝固后4℃保存备用。
(3)无菌条件下,用接种环蘸取少量大肠埃希菌DH5a或IM109菌液,在不含抗生素的LB琼脂糖平板上划线,37℃过夜培养。
(4)从LB平板上挑取一个单菌落,放入含2mlLB培养基的试管中,37℃恒温摇床220rpm振荡培养过夜。
(5)取500ul菌液,转入含50mlLB培养基的培养瓶中,37℃恒温摇床180rpm振荡培养至OD600=0.8-1.0。
(6)7000g,4℃,离心5min收集细胞。
(7)用25ml预冷50mmol/L CaCl2 溶液重悬细胞,冰浴30min。
(8)6000g,4℃,离心5min收集细胞。
(9)用4ml预冷100mmol/L CaCl2 溶液重悬细胞。
(10)加入1ml甘油混匀,100ul/冻存管分装,-80℃保存备用。
2.SUMO基因重组质粒的转化及扩增
(1)取10ngSUMO基因重组质粒,加入50ulDHα或JM109感受态细胞。
(2)冰浴30min 到42℃水浴,热休克60-90s 到冰浴5min。
(3)在试管中加入950ul不含抗生素的LB培养基,37℃恒温摇床220rpm振荡孵育40-60min。
(4)4℃4000g,离心2min收集细胞。
(5)取20ul菌液放入含抗生素LB琼脂糖平板,将细菌均匀涂至整个平板表面。
(6)37℃恒温培养箱中培养16-24h。
(7)试管中加入2-5ml含抗生素的LB培养基,挑取单克隆菌落放入试管。
(8)37℃恒温振荡培养过夜。
2.SUMO质粒DNA的提取
(1)用1.5ml离心管取少量菌液,离心后弃掉上清液。
(2)用250ul P1溶液重悬菌株,漩涡振荡使菌液重新完全悬浮。
(3)加入250ulP2溶液,轻轻涡旋4-6次混匀。
(4)加入350ulN3溶液,轻轻涡旋4-6次混匀。
(5)13000rpm(或17900×g)离心10min。
(6)用移液枪轻轻吸出上清放入QIAprep spin柱中,放置1-2min。
(7)13000rpm离心30-60s,弃滤液。
(8)500ul PB缓冲液,13000rpm 离心30-60s,弃掉滤液。
(9)加入750ul的PE缓冲液,13000rpm离心30-60s,弃掉滤液。
(10)13000rpm再次离心1min,甩干残留液体。
(11)将QIAprep spin柱置于一个新的1.5ml离心管中,加入50ul的EB溶液,室温放置10min。
(12)13000rpm离心1min,管底即为质粒DNA。
(13)检测质粒DNA的浓度。
(14)-20℃保存备用。
3.SUMO质粒瞬时转染
(1) 将生长状态良好的细胞接种于直径4-6cm的培养皿中,5% CO2,37℃培养箱内培养16-24h,细胞融合至60%-90%时可进行转染。
(2) 转染前1h将细胞培养液换成不含抗生素的培养液。
(3) 用Opti-EME培养液稀释4倍的Lipo2000试剂。
(4) 用Opti-EME培养液稀释SUMO质粒。
(5) 将上两步溶液按1:1比例混合配成转染复合液,室温,孵育20min。
(6) 将已接种细胞的培养皿中加入200ul转染复合液,充分混匀。
(7) 继续培养4-6h,更换正常培养液。
(8) 培养24-72h,镜下观察和检测带有荧光标记的SUMO质粒的表达。
4.带标签的SUMO的制备(以His-SUMO为例)
(1)培养细胞、诱导及收获。
(2)每200ml菌液收获的菌体加入5ml His裂解液,重悬沉淀。
(3)冰浴条件下,超声破碎沉淀。
(4)4℃,10000rpm,离心1h
(5)取上清液,加入Ni-NTA agarose,4℃,混合1-2h。
(6)将混合物装柱用His洗涤液洗涤,直到检测不到蛋白浓度。
(7)His洗脱液进行洗脱,按洗脱次序每管收集500ul。
(8)考马斯亮蓝染色检测蛋白。
5.SUMO化蛋白的检测
(1)培养细胞,待细胞融合至90%左右。
(2)PBS洗涤细胞2次,0.25%胰酶消化细胞。
(3)1000rpm,离心3-5min收集细胞。
(4)PBS洗涤细胞2次。
(5)1000rpm,离心3-5min,弃掉上清液。
(6)加入50ul细胞裂解液,冰浴10min。
(7)4℃,12000g,离心15min。
(8)取上清液,检测蛋白浓度。